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尊龙凯时小鼠甲基化年龄预测研究

发布时间:2025-07-17   信息来源:利彪栋

【服务介绍】DNA甲基化是衰老过程中一种重要的表观遗传变化。随着衰老的加剧,一些特定的甲基化位点(CpG)会表现出与年龄相关的动态变化。我们通过机器学习分析这些随年龄变化的CpG位点,建立了一种预测甲基化年龄的数学模型,称为表观遗传时钟。该时钟不仅能够量化生物衰老的速度,还能评估长寿和抗衰老干预措施的效果。

尊龙凯时小鼠甲基化年龄预测研究

尊龙凯时的技术为基础,研究团队对100只小鼠的血液基因组DNA进行了甲基化位点的初步检测,已建立了一个包含多个生物样本及其随小鼠月龄变化的甲基化频率的数据库。团队随后通过机器学习挑选出与小鼠月龄显著相关的甲基化位点,从而构建了甲基化年龄预测器。利用该预测器,研究人员成功预测了经历生殖压力的雌性小鼠的甲基化年龄,从而验证了方法的可行性。

【合作方式】技术服务

【检测对象】物种样本类型:小鼠血液,雌性/4个,雄性/3个

【技术方案】核心技术为甲基化重测序(Hi-Methylseq),结合亚硫酸盐转化,采用靶向扩增子高通量测序技术,实现多区段和多位点的精准甲基化定量分析。

【服务流程】在选定甲基化位点随小鼠月龄变化的显著性后,预测了生殖压力影响下的雌性小鼠的甲基化年龄研究结果。以下是部分分析结果: - 预测生殖压力雌性小鼠的甲基化年龄: - CpG1 - CpG2 - CpG3 - CpG4 - 甲基化年龄预测模型: - 甲基化年龄(month) - 加速效应(month) - 衰老加速组甲基化水平(实际年龄18月龄):440596727305 - 自然衰老组甲基化水平(实际年龄18月龄):373525823669172221681824 - 注:甲基化预测模型为多元线性方程式,检测小鼠样本的甲基化年龄时,只需将选定甲基化位点的甲基化水平带入模型,即可得出生物样本的甲基化年龄。

根据模型分析,自然衰老组小鼠(实际年龄18月龄)的预测甲基化年龄为1824月龄,而经过多次生殖压力的雌性小鼠(实际年龄18月龄)的预测甲基化年龄为222月龄,显示出396个月的加速衰老现象。

参考文献: [1] Rivero-Segura NA, Bello-Chavolla OY, Barrera-Vázquez OS, et al. Promising biomarkers of human aging: In search of a multi-omics panel to understand the aging process from a multidimensional perspective. Ageing Research Reviews, 2020, 64: 101164 [2] Petkovich DA, Podolskiy DI, Lobanov AV, et al. Using DNA methylation profiling to evaluate biological age and longevity interventions. Cell Metabolism, 2017, 25(4): 954-960 e6 [3] Stubbs TM, Bonder MJ, Stark AK, et al. Multi-tissue DNA methylation age predictor in mouse. Genome Biology, 2017, 18: 1-14 [4] Wang Y, Karlsson R, Lampa E, et al. Epigenetic influences on aging: a longitudinal genome-wide methylation study in old Swedish twins. Epigenetics, 2018, 13(9): 975-987